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《石室秘錄》卷一至卷五上半部分，以治法為綱，依次列舉了一百二十八種治法。卷五下半部分論述了五行、臟腑、陰陽、晝夜、四時等十七論以及兒科診法等。卷六為傷寒、中寒、中暑、水濕、熱症、燥症、內傷七門，每門中分別論述了相關疾病的治法，以及血症、腹痛、喉痛等十六種雜症的治法。這種以治法為綱的編寫方法，是本書的主要特點。陳士鐸在這部書中總結和記錄了自己的臨證經驗，具有很高的臨床指導價值。
陳士鐸
字敬之，號遠公，別號朱華子，又號蓮公，自號大雅堂主人，浙江山陰（今浙江紹興）人。約生於明朝天啟年間，卒於清朝康熙年間。據嘉慶八年《山陰縣誌》記載：“陳士鐸，邑諸生，治病多奇中，醫藥不受人謝，年八十餘卒。
卷一 禮集
正醫法
反醫法
順醫法
逆醫法
內治法
外治法
完治法
碎治法
大治法
小治法
偏治法
全治法
生治法
死治法
卷二 樂集
上治法
中治法
下治法
先治法
後治法
急治法
緩治法
本治法
末治法
不內外治法
陰治法
陽治法
卷三 射集
卷四 禦集
卷五 書集
卷六 數集
跋
