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第六冊的故事，延續《德利特醫生的馬戲團》。由於以前在馬戲團中，醫生他們所賺來的錢都被壞團長拿走了，所以從此之後便成立「合作事業」，將利益分給所有的工作同仁，並將在馬車中生活所發生的冒險故事，以「馬車」為名出書。
有一天醫生在一個小鎮上散步，正思索著演出節目的內容，突然看見一隻綠色的金絲雀在唱著歌，聲音極其優美。醫生想將牠買回去，才發現牠是一隻雌金絲雀。
這隻叫做皮皮尼拉的金絲雀對醫生說：「其實大家說雌金絲雀不會叫是亂講的。在金絲雀的社會中，雌金絲雀若是鳴叫，會被認為沒有禮貌，所以才漸漸不發出聲音了。」醫生對皮皮尼拉的身世遭遇很感興趣，所以製作筆記，寫了一本皮皮尼拉的「傳記」。這是醫生所寫的第一本動物傳記。
皮皮尼拉常在講自身遭遇時，唱許多牠自己作詞作曲的歌給醫生聽，醫生便想將這些搬上舞台，命名為「金絲雀歌劇」。當然由動物們所演出的「巴德魯比默劇」也要和金絲雀一起登台，所以動物們都大為興奮。
但是找不到飾演皮皮尼拉對手戲的男高音----她的前夫君克，於是醫生一行人，為了尋找那隻金絲雀去遍整個倫敦城。
不久他們便得知君克被關在倫敦郊區一個骯髒的動物店裡。醫生前去將牠買了回來，由君克那兒得知，在那個既骯髒，對動物又壞的店裡，有許多利用陷阱捕來的黑鳥，過著水深火熱的生活。他想將這些鳥買回來，但是沒有錢。最後醫生就被馬修．馬格裝扮成女人，一起潛入動物店中，冒險將這些鳥救出來。
「金絲雀歌劇」得以正式開場，由水鳥擔任漁夫，紅鶴擔任貴婦的角色，樂隊則遵照皮皮尼拉的意見，使用縫紉機的聲音、剃刀刮皮的聲音、鎖的聲音、鐵鎚敲鞋型的聲音等等。
終於，在倫敦有名的劇場內公開演出了皮皮尼拉一生的故事「金絲雀歌劇」，得到各方好評。那一天，英國女王及世界知名的小提琴家----巴卡尼尼也都前來觀看。
歌劇成功地演出六個月，醫生與動物們賺了好大一筆錢。
終於，馬戲團的演出結束了，他們又回到巴德魯比。醫生這才發現，由於長時間不在家，整個房子、院子都一片荒蕪，被留在家中的動物們都很寂寞。
然後，醫生決定將馬戲團解散，讓這些動物們去做一次快樂的旅行後，再送牠們回故鄉非洲及美國，花費了一筆數目相當龐大的費用。管家達普擔心，醫生從此以後又會過著一貧如洗的生活，所幸錢還剩了不少，他們得以平安地回到巴德魯比。
電影怪醫杜立德原著小說
