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21世紀初，由於對DNA的研究使得操控遺傳基因成為可能的事情。而在2031年春天的日本，我－梧桐孝不斷受奇怪的夢境困擾……新世代八犬傳展開！
西元2031年，人類已經可以控制遺傳基因。在當時，受到小行星「托塔奇斯」撞擊的南關東地區一度成為廢墟。
而就在關東的某所高中，擁有特殊能力的三位少年因為孝的母親受到奇美拉的襲擊而相遇。漸漸明朗化的「神女計畫」到底是什麼呢！？
